中药材质量受品种、产地、采收期、加工、储运及掺假等多方面因素影响，其质量控制是难题。本成果采用基于ITS-LSU D1/D3片段的DNA条形码（获中国发明专利授权，专利号：ZL 201110053038.1）和HPLC指纹图谱对中药材的遗传与化学差异进行评价，为药材品种的真实性与质量的稳定性、一致性提供鉴定方法，从而对中药材质量进行控制。本成果采用的ITS-LSU D1/D3片段包含ITS1、ITS2、LSU D1、LSU D2、LSU D3等多个高变异区域，能在个体水平上精确区分不同产地来源的药材，并筛选出一对适合药用被子植物的通用引物DUAN3、DUAN6。采用的HPLC指纹图谱可以根据色谱峰面积构建距离矩阵进行聚类分析，结合标准品及LC-MS/MS、GC-MS分析可以识别各色谱峰的化学成分。本成果在姜黄、阳春砂、乌榄等南药上得到广泛应用，相关研究发表在Biological & Pharmaceutical Bulletin. 2017, 40 (10):1638-1645；Plos One, 2014, 9(12):e114940。本研究所开发的技术还可以用于其它中药材种质、饮片、制剂及生药的质量检测与控制。