工厂化循环水养殖是现代化海洋农业的重要发展方向。在国家863计划等项目支持下，建立了重要海水鱼类（石斑鱼、大西洋鲑、鲆鲽鱼类）的工厂化循环水养殖生产体系，取得5项创新成果：（1）提出了循环水养殖系统“ARE”设计原则，实现了循环水设施装备全部实现国产化。（2）发现了海水鱼类饲料蛋白质水平与增重和水氨氮内在规律的“菱形特征”，提出了“生态营养饲料”概念。（3）建立了病害档案与病原库，制订了绿色生产技术规范；构建了贝—藻耦合废水处理系统；对养殖水进行生态修复与循环利用。（4）设计和首次系统运用了智能化水质在线监控系统和设施设备运行自动管理系统；（5）综合集成水产工业化养殖成套设施装备运用于生产，半滑舌鳎、石斑鱼、大西洋鲑鱼的平均养殖承载量较池塘产量提高3-20倍，系统造价较国际同类系统降低60%以上，鲆鲽鱼生态高值饲料较国际同类产品降低成本27.3%。