水上交通应急指挥系统针对全球范围内保障水上人命财产安全、提高水上突发事件的应急救援效率和救援成功率的重大需求，以现有海事、港口、航道和运输等相关基础预案为行动规范，建立了基于角色和任务的工作流授权模型，实现了水上交通应急指挥的工作逻辑控制；突破了水上交通应急信息的集成与融合关键技术，以水、陆地理信息系统为平台，对专业应急救助力量、社会应急救助力量、港航应急车辆、应急物资和应急装备等各类应急资源进行科学管理和调度，为水上交通事故救援、水上危险品泄漏应急处置、港口突发事件处置、航道断（碍）航应急处置、自然灾害的应急救援等提供综合、统一、集成、全面的信息支持；通过建立水上应急处置案例库推理系统，结合应急预案的智能化管理，辅助制定应急决策。系统能够有效应对和处置水上交通突发事件，达到了"快速反应、统一指挥和有效行动"的目的。