小麦赤霉病引起严重穗腐和产生毒素威胁着小麦生产安全和食品安全。近40年来我国一直依靠多菌灵等苯并咪唑类杀菌剂进行化学防治。我校对赤霉病菌的抗药性进行了连续26年监测，发现自然界从1992年开始出现抗药性菌株，至2003~2005年抗药性病原群体在江苏及安徽、山东、河南和湖北部分地区，已经发展到可以引起抗药性赤霉病流行的水平，而且在国际上首次探明抗药性赤霉病菌显著增加小麦的真菌毒素污染，危害人们健康。针对我国替代多菌灵防治小麦赤霉病的技术需求，南京农业大学在抗药性机制和药剂与靶标分子互作研究基础上，研发了具有自主知识产权的新型杀菌剂——30%戊唑醇和福美双复配杀菌剂（戊福）。该产品防治小麦赤霉病的效果可达70%~80%，并能兼治叶部和穗部多种真菌病害，延缓衰老和促进光合作用，用药1-2次可增产10%以上。与江苏省农药研究所股份有限公司合作研发的25%氰烯菌酯（JS399-19）悬浮剂，是目前国内外防治小麦赤霉病的原创性特效新型杀菌剂，弥雾喷施的防效可达90%以上，并能有效控制真菌毒素污染，保障面食品安全。该成果分别荣获中国石油和化学工业协会技术发明二等奖和国家科技进步二等奖。