多子小瓜虫 (Ichthyophthirius multifiliis)，是一种鱼类专性寄生原生纤毛虫。由该病原引起的小瓜虫病主要危害鱼苗、鱼种，严重时可引起病鱼大批死亡，是一种世界性流行的鱼类病害。传统中能有效防治小瓜虫病的药物由于残留高、毒性大已经被禁用。急需开发新的安全高效的药物。本发明采用酒精提取、石油醚和乙酸乙酯萃取以及活性追踪等方法，从桑白皮中分离纯化鉴定了杀多子小瓜虫的活性化合物桑酮G和桑酮O。本发明公开了桑酮G、桑酮O在制备杀灭鱼类寄生纤毛虫药物中的应用。该两种活性化合物杀虫效果相似，在4 h内全部杀死成虫、包囊、幼虫的浓度分别为6.25 mg/L、12.5 mg/L、2 mg/L。低浓度（1、0.5、0.25、0.125 mg/L）的桑酮G和桑酮O处理幼虫2 h，能显著降低幼虫的感染力，健康草鱼感染小瓜虫的感染率和感染强度与对照组相比差异显著。在体治疗和预防实验中，桑酮G和桑酮O的药浴浓度在4 mg/L时，连续用药10天，可完全治愈多子小瓜虫病，草鱼的存活率为100%，感染率和感染强度为0；药浴浓度在2 mg/L时，混养体系中健康鱼的感染率为0，患病鱼的感染率分别下降到26.7%和20%。表明桑酮G和桑酮O能达到防治小瓜虫病的效果。桑酮G、桑酮O来源于桑科植物，对人安全，对环境无残留无污染；桑酮G和桑酮O对草鱼的96 h半致死浓度分别为37.98和26.87 mg/L，对草鱼的安全浓度分别为8.44和7.25 mg/L，其对鱼的安全浓度分别是有效防治浓度(2 mg/L)的4.2和3.6倍，可见对鱼安全；桑酮G、桑酮O在桑白皮中含量高，桑白皮来源桑树，资源丰富，其提取制备工艺简单，具有广阔的应用前景。