教育背景
2009-2014年,美国加州大学河滨分校计算机与工程系,博士(导师:Tao Jiang教授和Thomas Girke教授)
2006-2009年,北京交通大学软件学院,硕士
2002-2006年,北京交通大学计算机与信息技术学院,本科
工作经历
2014年至今,北京交通大学软件学院,副教授
项目课题经历
近五年正在主持和主持过4项科研项目,还参与过国家自然科学基金重大项目和美国国家自然科学基金项目
论文、成果、著作等
代表性论文(共同第一作者#,通讯作者*):
[1] Ergude Bao*, Fei Xie, Changjin Song, Dandan Song*. FLAS: fast and high throughput algorithm for PacBio long read self-correction. Bioinformatics (special track for RECOMB-Seq), 2019
[2] Ergude Bao#*, Changjin Song#, Lingxiao Lan. ReMILO: reference assisted misassembly detection algorithm using short and long reads. Bioinformatics. 2018
[3] Ergude Bao#*, Lingxiao Lan#. HALC: High throughput algorithm for long read error correction. BMC Bioinformatics, 2017
[4] Ergude Bao, Tao Jiang, Thomas Girke*. AlignGraph: algorithm for secondary de novo genome assembly guided by closely related references. Bioinformatics (special issue for ISMB), 2014
[5] Ergude Bao, Tao Jiang, Thomas Girke*. BRANCH: boosting RNA-Seq assemblies with partial or related genomic sequences. Bioinformatics, 2013
[6] Ergude Bao, Tao Jiang, Isgouhi Kaloshian, Thomas Girke*. SEED: efficient clustering of next generation sequences. Bioinformatics, 2011
[7] 包尔固德*, 李伟生, 范东睿, 杨扬, 马啸宇. Godson-T众核体系结构上的Broadcast性能优化. 计算机研究与发展, 2010
专利、著作版权等
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