生物多样性的重要来源是遗传重组和交换（crossover，CO）。通过染色体重组，杂交后代可以产生出多种变异类型，为新品种的选育提供了丰富的材料。翟继先课题组已独立开发了一种世界领先的、可用于构建高精度全基因组crossover图谱的高通量测序方法。该方法是在Hi-C（High-throughput detection of Chromosomal interactions）技术的基础上发展而来，我们将其称之为“HiCO-seq” (HiC for CrossOver)。Hi-C来源于染色体构象捕获（chromosome conformation capture，3C），是一种利用高通量测序技术来研究全基因组染色质DNA三维空间结构的方法，目前主要用于染色质高级结构与基因表达调控方面的研究。与传统的测序方法以及microarray相比，HiCO-seq技术在样本制备过程和数据分析方面都有了很大的改进，可以直接对F2整个群体进行合并测序研究，不需逐一分析，且一次可检测出上千个遗传重组位点，不仅在基因组覆盖度上有了显著提高，还极大地简化了实验流程，降低了实验成本。因此，运用HiCO-seq技术，可以对全基因组的crossover位点特征及发生机制进行高效分析。由于我们的技术大大降低了检测染色体重组的成本，并显著增加了数据精度。未来希望能够结合生物工程微流控技术建立单细胞HiCO-seq技术体系和平台，这将极大地节约材料准备时间。尤其是对于只能产生少量后代的物种（如小鼠、人类等哺乳动物）来说，单细胞HiCO-seq技术不再对样品量有要求，因此在遗传和医学研究领域中都有很高的应用前景和价值。图1：单染色体测序技术