低分子肝素由普通肝素解聚而得。与普通肝素相比，低分子肝素具有抗FXa作用强、抗FIIa作用弱、生物利用度高、血浆半衰期长、较低的出血倾向及较少的血小板减少症等优点，可应用于防治深部静脉血栓、肺栓塞等疾病。低分子肝素是不同聚合度的肝素寡糖组成的混合物，研究表明不同聚合度的肝素寡糖具有不同的生物学活性。但肝素寡糖的分离纯化非常困难，相邻聚合度的寡糖只相差两个单糖，分子量差别也非常小，这给肝素寡糖的分离增加的难度。本发明利用肝素酶裂解肝素，并经凝胶层析分离制备了聚合度为十二的肝素寡糖。本专利肝素十二寡糖经动物实验验证具有明显的抗动脉粥样硬化作用，具有开发成抗动脉粥样硬化药物的潜力。