本发明涉及一种快速鉴定扇贝品种的多重PCR引物及方法。快速鉴定扇贝品种的多重PCR引物，由栉孔扇贝引物、华贵栉孔扇贝引物、海湾扇贝引物和虾夷扇贝引物组成。鉴定方法包括以下步骤：提取扇贝基因组总DNA，进行多重PCR扩增，根据琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物大小判定待检测扇贝种类。本发明的鉴定引物及多重PCR方法可以灵敏、快速地确定待检测扇贝样品的种类。