本发明公开了一种低粘度海藻酸钠的制备方法，将浓度为0.1～3％(w/v)的海藻酸钠溶液的pH值调节至4.0～6.0后，再加入(NaPO3)3并搅拌0.5～1.5h，得到海藻酸钠-三偏磷酸钠混合溶液；向海藻酸钠-三偏磷酸钠混合溶液中加入Na2CO3或NaOH，反应5-20min后升温至20～90℃，即获得低粘度海藻酸钠溶液；将低粘度海藻酸钠溶液于-18℃条件下冷冻10～15h，然后进行冷冻干燥，获得低粘度海藻酸钠。低粘度的海藻酸钠在纺织印染工业、医疗保健、食品生产等领域有广阔的应用。在染整行业的应用，低粘度海藻酸钠利于提高染料的给色量。